1、肝炎患者由於胃黏膜水腫，小腸絨毛變粗變短，膽汁分泌失調等因素，消化吸收機能大大減弱。而甲魚含有很豐富的蛋白質，病人食後不僅難以吸收，反而會加重肝臟負擔，嚴重時肝細胞還會大量壞死，血清膽紅素劇增，血漿濃度升高，誘發肝昏迷。
2、失眠、孕婦及產後泄瀉也不宜食用。雖然它具有滋陰益腎的功效，但是甲魚性味咸寒，有著較強的通血絡、散瘀塊作用，因而有一定墮胎之弊，尤其是鱉甲的墮胎之力比鱉肉更強。
3、腸胃功能虛弱、消化不良的人應慎吃。尤其是患有腸胃炎、胃潰瘍、膽囊炎等消化系統疾病患者不宜食用。脾胃虛弱的人，更不能多吃，否則往往使入不思飲食，肚腹脹滿，甚至引起腹瀉
4、幼兒要少食甲魚。甲魚屬於高蛋白質滋補品，兒童脾胃嬌嫩，在食用時則有可能導致孩子消化不良，加重脾胃的負擔，因此要少食。
