1、性質不同：公務員屬於國傢的政府部門的工作人員，無論是國傢公務員還是在地區工作的公務員都是行政編制的工作性質；而事業編制屬於科研單位、教育單位、文化單位，新聞、廣播、出版單位等。
2、工資來源不同：公務員的工資全部是財政全額撥款；而事業編制的工資和活動經費的開支渠道除一般由國傢事業費開支的外，還有部分事業單位的經費采取自收自支、差額補貼等辦法。
3、升職機會不同：事業編制的工作人員升職的機會不大，因為事業編制的職位比較少；而一般的公務員升遷機會要大的多，還可以一直升官。
4、權限和范圍不同：雖然公務員和事業單位同屬於編制內人員，但公務員擁有的是公務員行政編制，而事業單位擁有的是事業單位編制。因此，二者的編制權限和范圍不一樣。
5、人員架構不同：公務員的級別由低到高，分別是辦事員、科員、副科、正科、副處、正處和其他更高的職位；而事業單位一般分為管理崗位、事業單位的技術崗位、事業單位的工勤崗位。
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