幽門螺桿菌感染是否會造成嚴重的後果與個體有關。胃酸本身具有強酸性，胃本身也是一個無菌容器，而幽門螺桿菌產生大量的尿素酶能夠分解出氨，氨能中和胃酸，使局部的pH值升高，使其可以在胃內定殖。幽門螺桿菌感染後，雖然對胃會有不同程度損傷，但其中50%的人沒有任何癥狀，約10%-15%的人會發展成胃潰瘍，約5%會發展為癌變。近年來根據研究發現幽門螺桿菌感染也與血液等其他系統疾病有關。但是幽門螺桿菌感染後會不會發展成嚴重的疾病，還與其他因素有關。比如，個體差異、胃癌傢族史、胃黏膜病變情況（如萎縮、腸化、潰瘍等）、是否長期服用抑制胃酸藥物及非甾體抗炎藥等。幽門螺旋桿菌感染是可以治愈的，但是有一部分患者效果不理想或者易反復發作。
