橋本甲狀腺炎的治療方法主要是針對甲狀腺功能異常的治療。橋本甲狀腺炎是自身免疫性甲狀腺炎中最常見的一種，是免疫系統出瞭錯誤，認為甲狀腺中的甲狀腺球蛋白、甲狀腺微粒體是敵人，對身體產生瞭防禦反應，產生自身免疫損傷，造成甲狀腺組織不斷的被破壞，患者表現甲狀腺可以一過性的增大，但往往最後甲狀腺會萎縮，而且甲狀腺功能逐漸受損傷，會出現甲狀腺功能減退。當然，在中間病程的其中某個階段，患者可以出現甲狀腺激素過量，但是並不是甲狀腺本身明顯合成增多，而是炎癥破壞。診斷橋本甲狀腺炎主要是根據血液中甲狀腺自身抗體和甲狀腺的超聲，如果診斷瞭橋本甲狀腺炎，甲狀腺功能化驗是正常，無需進行所謂橋本氏病患者的對因治療，僅僅定期復查，可以一年查一次甲功、甲狀腺超聲，飲食沒有什麼特別需要註意。如果發現是甲狀腺功能的異常，治療橋本甲狀腺炎是最主要的方法，也就是如果出現甲狀腺功能減退，患者可能進行甲狀腺激素的替代治療。如果出現甲狀腺功能亢進，這個時候患者要特別小心，要分清到底是甲狀腺炎癥組織破壞造成的一過性甲狀腺毒癥，還是甲狀腺組織真正的合成、分泌的甲狀腺激素增多。患者進行相應的鑒別診斷後，再進行相應的治療。
