扁桃體摘除是有很嚴格的手術適應癥的，一般對於反復扁桃體發炎，一年超過四次以上或半年超過三次以上，是需要做扁桃體手術；另外扁桃體發炎引起扁桃體周圍膿腫需要手術；扁桃體肥大導致鼾癥需要手術；扁桃體發炎引起風濕性心臟病、風濕性關節炎、腎炎都需要做手術；扁桃體炎引起鼻竇炎、中耳炎、氣管炎需要手術；扁桃體白喉帶菌需要手術；扁桃體良性腫瘤也需要手術。對於必須做手術的以上這些情況，手術的利是大於弊的。對於沒有以上這些手術適應癥的患者，慢性扁桃體炎可以保守治療，這樣可以保護扁桃體免疫的功能，而不至於造成扁桃體切除術後局部瘢痕形成、咽異物感形成、慢性咽炎形成。對於不需要做扁桃體手術摘除的患者，應該嚴禁手術。
