前列腺在顯微鏡下的結構，可以看見是由大量管道狀腔隙樣結構的前列腺小管組成，這種腺體小管主要的功能是運輸前列腺液到達精囊腺，所以前列腺液實際上在管道通暢的情況下，可以順利的排射到後尿道，進而排出到體外。當前列腺局部出現感染性病變時，前列腺小管的管線狀結構就會發生感染性的狹窄、梗阻，導致局部的前列腺液淤滯、瀦留，從而形成一個微小的囊腫。隨著時間的進展，囊腫逐漸長大就可以形成影像學上比較明顯的囊腫。但是不必擔心，這種囊腫體積一般都不會太大，長到1cm就算是很大的，很少有比這個體積范圍更大的囊腫。即便如此，前列腺囊腫對前列腺的生理功能，包括對人的身體健康狀態都不會有大的負面影響，所以對前列腺囊腫不主張進行過於積極的治療，臨床觀察就可以。
