安宮牛黃丸的副作用有肢寒畏冷、面色蒼白、冷汗不止等全身不適癥狀，極少數的患者服用該藥物以後會出現體溫偏低的情況。少數患者服用安宮牛黃丸以後，全身會出現皮膚丘疹樣斑塊、瘙癢等過敏樣反應，長期服用安宮牛黃丸可能會對肝腎功能造成一定的損傷，所以肝腎功能異常的患者不建議服用。孕婦服用安宮牛黃丸可損傷胎氣，所以孕婦要慎用。安宮牛黃丸的主要功效是清熱解毒、鎮靜開竅等，可用於治療由春溫、風溫、暑溫、疫毒等引起的神昏，也可以緩解高熱煩躁、驚厥、抽搐等。患有流行性腦脊髓膜炎、乙型腦炎、中毒性腦病、敗血癥等的患者，出現上述癥狀時都可以服用安宮牛黃丸。
