扁桃體發炎主要是細菌感染導致的，最主要的治療是抗生素的治療，抗生素常見的有青黴素類，比如阿莫西林，還有頭孢類，比如頭孢拉定、頭孢呋辛酯、頭孢克洛、頭孢地尼和頭孢克肟等等，青黴素類和頭孢類容易出現過敏反應，所以在服用時如果出現瞭皮疹或瘙癢，或者既往有過敏史，要註意停藥。除瞭這兩類藥，還有紅黴素類，常用的有克拉黴素等等，如果對青黴素類或頭孢類過敏，可以考慮服用紅黴素，還有一類就是喹諾酮類，常用的有左氧氟沙星、甲磺酸、莫西沙星等，這類藥物在選擇的時候要註意18歲以下的兒童不建議使用，因為會影響骨骼的發育。除瞭抗生素的治療是比較重要的治療，還要根據炎癥的情況可以選擇口服和輸液治療，比如說比較嚴重的情況，有化膿和有全身癥狀，建議可以輸液治療。除此之外，可以適當的使用霧化吸入治療，通過機器把藥物直接霧化到口咽部來促進局部炎癥的緩解，還可以配合漱口液治療，含漱液來殺滅口咽部的細菌，也有助於盡快恢復。此外還可以輔助清熱解毒、利咽消腫的中成藥治療，比如清熱解毒口服液、牛黃解毒片這一類的藥物，也可以有效的幫助快速的緩解炎癥。
