多囊腎的患者如果在囊腫相對比較小、腎臟體積比較小的時候，可能沒有相關的臨床癥狀，但是隨著囊腫增多、增大，病人會出現腎區的疼痛，或者有腹脹的感覺，主要是因為腫大的腎臟被膜受到牽拉，可以出現相關的癥狀。還有多囊腎在出現各項並發癥的時候，可能會有相關的表現。囊腫如果出現瞭破裂或者出血，病人會有明顯劇烈的腰疼、腹疼情況，病人會出現肉眼血尿。如果合並感染，可以出現腰疼、發燒、惡心、嘔吐。有些病人還可以伴有泌尿系感染的癥狀，像尿頻、尿急、尿痛。多囊腎隨著腎功能受到損傷，有的病人會出現高血壓或者血壓高的難以控制。如果當多囊腎影響到腎功能，導致腎功能衰竭的時候，病人還可以出現腎衰竭相關的表現，比如會有腎性貧血的發生、乏力、皮膚瘙癢、電解質紊亂等相關的表現。
