多發性胃息肉的治療跟息肉大小、病理性質密切相關，胃底腺息肉治療，往往跟質子泵抑制劑過度使用密切相關，大多數為散發，部分也可能是傢族性息肉病在胃內的一種表現。對於散發或者跟質子泵抑制劑相關的胃底腺息肉，幾乎沒有惡變潛能。但如果是傢族性息肉病，可能會存在異型增生，甚至癌變。所以，其處理方法是大於一厘米的應該進行積極切除。如果是多發，並且合並十二指腸腺瘤，需要警惕傢族性息肉病，還應做結腸鏡的檢查。往往息肉密密麻麻，非常多，徹底切除不太可能。但如果考慮是質子泵抑制劑、藥物服用所引起，建議少用或者停用PPI，有可能就有好轉。對於此類患者其預後都非常好，不建議常規復查。而如果是傢族性息肉病，應該密切監測其變化。還有胃增生性息肉往往也可能多發，對於大於0.5厘米的建議徹底切除，往往息肉都能進行根治。對於胃腺瘤，多發其實並不多見，但是也有，胃腺瘤息肉合並胃癌比較多。所以，應該建議全部進行切除，並且要根除幽門螺桿菌。由此可見，胃息肉處理，根據其病理、大小不同，有些能夠完全切除。但如果是比如傢族性息肉病在胃內的一個表現，基本上不可能完全根除。
