1、常規放置
木瓜的保存方式是很影響它的味道和口感的，不管是未成熟的還是比較成熟的都要註意。青木瓜富含木瓜蛋白酶等物質，口感和味道還不怎麼好，因此未成熟透的青木瓜不適合生食。青木瓜在摘下來後，往往很耐儲藏，且有一定的自熟能力，因此有不少人探親訪友時遇不上成熟木瓜，也要摘一些青木瓜回去。如果帶回來的木瓜還沒有熟透到表皮，也即是表皮還是深綠色，還沒有泛黃或是淡橘紅色，木瓜按壓起來還很硬，則可以常規放置，一邊食用一邊等木瓜自己成熟到表皮瞭，再做其他保存處置。註意，木瓜要放置在陰涼幹燥處，避免陽光直射，往往能儲藏一兩個月以上。
2、冰箱冷藏
該方法的話隻要傢裡有冰箱或者有冰櫃、冰庫都可采取，也是最普遍和最常見的好方法。七八分成熟的木瓜最適合冷藏，不但保存時間長，往往能保存半個月以上，且不影響口感和味道，但建議冷藏保存時間最好控制在10天以內。過熟的木瓜，即使是冷藏，也往往不到一周即發生軟爛，且最後口感和味道變得很差。青木瓜不適合冷藏，很多品種的青木瓜在低溫下不但不能自然熟，還會導致木瓜變得苦澀難以下咽。
